2012年中国科学院超级计算中心分子模拟软件讲习班通知

作者: 2012-08-07 14:15 来源:
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为普及和推广高性能计算化学软件使用、培养高性能计算化学专业人才,中科院计算机网络信息中心理论物理研究所、清华大学、NVIDIA将于2012年9月17~20日在北京联合举办2012年分子模拟软件LAMMPS &GROMACS讲习班。

本次培训将面向LAMMPS和GROMACS软件使用、本着“理论指导实践、学以致用、加强交流”目的,利用中科院超算中心高性能计算机系统“深腾7000”所提供的一流高性能计算软硬件环境,为广大学员带来高性能计算化学的深度体验。在培训期间,我们将为广大学员提供上机实践的机会。

LAMMPS全称“大规模原子分子并行模拟器”,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作。它可支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,支持多种势函数并具有良好的并行扩展性。

GROMACS是用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。它的模拟程序包包含GROMACS力场(蛋白质、核苷酸、糖等),研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。

◆ 培训对象

深腾7000用户、从事计算化学、计算材料、计算生物等研究的科研院所和高校教师、研究生、科研工作人员及相关企业工程师。

培训时间

2012年9月17日~20日,报名截止时间:2012年9月9日,名额有限,报名从速。

◆ 培训费用包括教材费、培训费、上机费、午餐费

科学院院内学员:¥800元/人;

院外教育科研学员:¥1000元/人;

企业单位学员:¥1200元/人。

◆ 培训地点

中国科学院计算机网络信息中心5层514会议室

详细地址:北京市海淀区中关村南四街四号中科院软件园区2号楼

◆ 报名方式

按照报名回执表的要求填写各项内容,然后发邮件到liuqian@sccas.cn ,我们将在一个工作日之内给予回复。联系人:刘倩博士,联系电话:010-58812143。

◆ 付款信息

电汇(推荐):截止日期2012年9月10日(含)。凭汇款单在签到时领取发票(发票项目:超算计算化学培训费),请在回执中填写正确的发票单位名称及超算计算化学培训。

收款单位全称:中国科学院计算机网络信息中心

开户行名称:中国工商银行海淀支行营业部

账号:0200049609200016431

现场付款:签到当天可以直接用现金或支票付款,并开具发票

◆ 拟定培训内容:

· LAMMPS

  LAMMPS软件理论知识和软件使用方法

    LAMMPS软件上机实践、软件安装编译

· GROMACS

  GROMACS软件理论知识和软件使用方法

  GROMACS软件上机实践、软件安装编译

· 中国科学院超级计算环境介绍

· GPU加速LAMMPS、GROMACS计算介绍

· LAMMPS、GROMACS软件应用实例

市内乘车路线

1、机场乘车线路:乘坐民航班车(首都机场—中关村)终点(即四环保福寺桥)下车,换乘641或619到海淀交通支队站下车;

2、北京西客站乘车线路:乘坐319到海淀交通支队站下车;

3、北京站乘车线路:乘坐地铁2号线到西直门站,换乘城铁13号线到知春路站下车。

附近公交站:海淀交通支队、知春里东站,具体公交路线请查询:http://www.bjbus.com/index.htm

  报名回执表请详见附件。

  更多详情请访问:http://www.vlcc.cn/html/2012_MD_training1.html

附件: