近日，深圳市中国科学院仙湖植物园发来感谢信，对科学数据中心在“陆地植物系统发育平台”研发工作中的大量投入和技术支持表示由衷感谢，感谢对该平台研发的有力推进和项目参与人员的卓越贡献，顺利完成了陆地植物系统发育平台研发并投入使用。

以中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室和深圳市中国科学院仙湖植物园的科研实际需求为牵引和依托，2009年5月，深圳市中科院仙湖植物园、中科院北京植物所和中科院计算机网络信息中心“三方两地”共同启动了陆地植物系统发育平台的建设项目。旨在加强生物信息技术在生物系统发育研究领域的作用，搭建基于海量信息的数据分析平台，逐步构建陆地植物的系统进化树（Tree of Life，TOL），支撑生物系统发育的应用研究。

在合作三方的共同努力下，陆地植物系统发育数据分析平台初战告捷，目前在科学数据中心进行了部署并提供全面的运行维护。09年8月中旬，科学数据中心技术人员在深圳对植物所和仙湖植物园的相关科研用户进行了数据分析平台的使用培训。科研人员通过远程访问部署在数据应用环境中的“陆地植物发育系统数据分析平台”，可以对实时更新的公共数据库自动获取、筛选，同时，还可以把实验自测数据通过平台提交并自动整合。科研人员基于该平台开展一系列的数据提取、比对分析，研究植物间亲缘关系，构建植物系统发育的生命树。12月31日的深圳特区报对该项目工作予以了特别报道（http://sztqb.sznews.com/html/2009-12/31/content_913443.htm ）。

陆地植物系统发育数据分析平台用户界面图

目前，该平台已实现面向整个中国陆地植物的rbcL、atpB和matK等基因数据从国际公共数据库的自动获取、数据清洗，整合了陆地植物的分子数据库系统包括苔藓植物、蕨类植物、裸子植物和被子植物在内的共４４７７２条分子。支撑实验数据与公共数据的整合，支持科研成果未发表前的数据挖掘分析，还集成了数据抽提、多序列比对、编辑清洗、分模型构树、组装评估、可视化编辑等一系列公认的分析算法和模型，实现陆地植物发育系统生命树的流程化构建，为科研人员提供了资源有效整合的数据应用环境，提高了研究效率和准确性。

平台投入运行后，仙湖植物园和植物所已有４０多名专业人员开始使用。将于2010年1月下旬再次组织培训交流，三方参与开发的技术人员、科研用户以及其他相关人员将深入研讨，继续推进和完善该平台的应用，并结合科研实际拓展应用技术和应用领域，不断探索促进数据密集型科研创新。