2012年8月8日，科研在线文档库2.0版（DDL 2.0.0）正式发布上线，服务网址：http://ddl.escience.cn/。新版科研在线文档库进一步完善了标签功能，实现了更便捷的文档分类与整理，支持新建/编辑文档及多选文档时的标签添加与管理、标签检索与自动完成提示、标签导航栏自定义排序等，支持基于搜索结果的文档整理。新增文件访问热度查询功能，用户可以方便的查阅文件访问情况。

科研在线文档库是基于中科院“十一•五”信息化建设专项中的研究成果Duckling协同工作环境套件研发的文档协作与管理工具，采用云服务的模式，为科研团队提供资料上传和整理、信息共享、协同编辑、沟通交流等在线服务。它于2011年底正式上线运行，由中科院计算机网络信息中心承担建设和运维，截至目前已经有2600余名用户注册使用科研在线文档库服务，创建团队700余个。